Bienvenue au laboratoire M2ish, 
Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte


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Présentation du laboratoire M2ish

Un dialogue permanent existe dans l'intestin entre le microbiote et les cellules de l'hôte. Avec la caractérisation moléculaire des pathobiontes bactériens et les données issues des études d'association pangénomiques (GWAS) sur diverses pathologies, il est devenu évident qu'il existe une évolution parallèle des pathobiontes et des hôtes.

Depuis plus de vingt ans, l'unité M2iSH étudie l'interaction entre les cellules de l'hôte et les bactéries, en particulier les pathobiontes Escherichia coli associés aux maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI), notamment la maladie de Crohn (MC), une inflammation chronique de l'intestin caractérisée par une hyperactivation du système immunitaire, et le cancer colorectal (CCR).

Il est désormais bien établi que les réponses inflammatoires anormales nécessitent une interaction entre la susceptibilité génétique de l'hôte et le microbiote intestinal. Plusieurs éléments de preuve soutiennent l'idée que la maladie de Crohn résulte d'une réponse immunitaire excessive contre des organismes commensaux ou des pathobiontes intestinaux.

Nous avons été pionniers en rapportant que la muqueuse iléale des patients atteints de MC est anormalement colonisée par des E. coli adhérents-invasifs (AIEC). Nous avons étudié comment ces bactéries peuvent être impliquées dans l'apparition ou la récidive de la MC chez des patients génétiquement prédisposés. De plus, comme un lien potentiel entre l'inflammation chronique et le cancer pourrait exister, nous avons ouvert un nouveau champ de recherche concernant le rôle des E. coli producteurs de colibactine (CoPEC) dans le développement du cancer colorectal et leur potentiel en tant que biomarqueur pour améliorer la prise en charge des patients.

Dans ce contexte, nos projets de recherche précédents se sont concentrés sur :
(i) la caractérisation des souches d'E. coli associées à la maladie de Crohn et au cancer colorectal,
(ii) le dialogue hôte-bactérie au niveau de la muqueuse intestinale,
(iii) le développement d'outils diagnostiques innovants et de thérapies.

Nos projets de recherche actuels sont structurés autour de trois axes de recherche interactifs :

  • Axe 1 : Étude de la virulence et de la résistance aux antibiotiques des pathobiontes Escherichia coli impliqués dans les maladies intestinales chroniques, telles que la maladie de Crohn et le cancer colorectal (Responsable thématique : Richard Bonnet).
  • Axe 2 : Analyse des réponses de l'hôte à l'infection par des pathobiontes E. coli impliqués dans les pathologies intestinales chroniques (Responsables thématiques : Hang Nguyen et Jérémy Denizot).
  • Axe 3 : Développement de nouveaux biomarqueurs et de thérapies personnalisées innovantes (Responsables thématiques : Mathilde Bonnet et Anthony Buisson).


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Un dialogue permanent existe dans l'intestin entre le microbiote et les cellules de l'hôte. Avec la caractérisation moléculaire des pathobiontes bactériens et les données issues des études d'association pangénomiques (GWAS) sur diverses pathologies, il est devenu évident qu'il existe une évolution parallèle des pathobiontes et des hôtes.

Depuis plus de vingt ans, l'unité M2iSH étudie l'interaction entre les cellules de l'hôte et les bactéries, en particulier les pathobiontes Escherichia coli associés aux maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI), notamment la maladie de Crohn (MC), une inflammation chronique de l'intestin caractérisée par une hyperactivation du système immunitaire, et le cancer colorectal (CCR).

Il est désormais bien établi que les réponses inflammatoires anormales nécessitent une interaction entre la susceptibilité génétique de l'hôte et le microbiote intestinal. Plusieurs éléments de preuve soutiennent l'idée que la maladie de Crohn résulte d'une réponse immunitaire excessive contre des organismes commensaux ou des pathobiontes intestinaux.

Nous avons été pionniers en rapportant que la muqueuse iléale des patients atteints de MC est anormalement colonisée par des E. coli adhérents-invasifs (AIEC). Nous avons étudié comment ces bactéries peuvent être impliquées dans l'apparition ou la récidive de la MC chez des patients génétiquement prédisposés. De plus, comme un lien potentiel entre l'inflammation chronique et le cancer pourrait exister, nous avons ouvert un nouveau champ de recherche concernant le rôle des E. coli producteurs de colibactine (CoPEC) dans le développement du cancer colorectal et leur potentiel en tant que biomarqueur pour améliorer la prise en charge des patients.

Dans ce contexte, nos projets de recherche précédents se sont concentrés sur :
(i) la caractérisation des souches d'E. coli associées à la maladie de Crohn et au cancer colorectal,
(ii) le dialogue hôte-bactérie au niveau de la muqueuse intestinale,
(iii) le développement d'outils diagnostiques innovants et de thérapies.

Nos projets de recherche actuels sont structurés autour de trois axes de recherche interactifs :

  • Axe 1 : Étude de la virulence et de la résistance aux antibiotiques des pathobiontes Escherichia coli impliqués dans les maladies intestinales chroniques, telles que la maladie de Crohn et le cancer colorectal (Responsable thématique : Richard Bonnet).
  • Axe 2 : Analyse des réponses de l'hôte à l'infection par des pathobiontes E. coli impliqués dans les pathologies intestinales chroniques (Responsables thématiques : Hang Nguyen et Jérémy Denizot).
  • Axe 3 : Développement de nouveaux biomarqueurs et de thérapies personnalisées innovantes (Responsables thématiques : Mathilde Bonnet et Anthony Buisson).